За виданням “Волости и важнейшие селения Евр. России, вып. III” (1885) – № 1504:

Колишнє власницьке містечко Нова Мурафа на річці Мурафі. Дворів 210, мешканців 1300. 2 православні церкви, 2 єврейські молитовні будинки, 3 заїзди, ярмарка кожні 4 тижні в неділю, 2 водні млини.

1949 року, згідно з Указом ПВР УРСР від 29.9.1949 «Про ліквідацію Юридико-Шаргородської і Старомурафської сільрад Шаргородського району, Вінницької області», Мурафа отримала назву “Жданове”. 1989 року була повернута історична назва – Мурафа.